Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEURL1BA8MQ27 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEURL1BA8MQ27 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEURL1BA8MQ27 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL1BA8MQ27 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEURL1BA8MQ27 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms