Protein–RNA interactions for Protein: A6NNX1

RIIAD1, RIIa domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIIAD1A6NNX1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIIAD1A6NNX1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIIAD1A6NNX1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms