Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTLL13PA6NNM8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL13PA6NNM8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms