Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A6NL46 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A6NL46 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A6NL46 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A6NL46 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A6NL46 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A6NL46 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A6NL46 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A6NL46 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A6NL46 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A6NL46 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
A6NL46 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
A6NL46 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A6NL46 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NL46 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NL46 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NL46 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NL46 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NL46 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NL46 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NL46 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NL46 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NL46 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NL46 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NL46 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NL46 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NL46 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NL46 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NL46 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NL46 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NL46 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NL46 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NL46 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NL46 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NL46 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NL46 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NL46 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NL46 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NL46 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A6NL46 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A6NL46 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A6NL46 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
A6NL46 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A6NL46 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
A6NL46 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A6NL46 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A6NL46 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NL46 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NL46 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NL46 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NL46 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NL46 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NL46 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NL46 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NL46 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NL46 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NL46 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NL46 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NL46 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NL46 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NL46 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NL46 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NL46 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NL46 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NL46 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NL46 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NL46 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A6NL46 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A6NL46 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A6NL46 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A6NL46 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A6NL46 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A6NL46 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NL46 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NL46 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NL46 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NL46 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NL46 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NL46 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NL46 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NL46 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NL46 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NL46 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NL46 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A6NL46 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms