Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RGPD3A6NKT7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RGPD3A6NKT7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD3A6NKT7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD3A6NKT7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD3A6NKT7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD3A6NKT7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD3A6NKT7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD3A6NKT7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD3A6NKT7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD3A6NKT7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD3A6NKT7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD3A6NKT7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD3A6NKT7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD3A6NKT7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD3A6NKT7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD3A6NKT7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD3A6NKT7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms