Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP73A6NFT4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms