Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM49BA6NDI0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms