Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A4D1N5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A4D1N5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A4D1N5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4D1N5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A4D1N5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms