Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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