Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC78A2IDD5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms