Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQD8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2PQD8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQD8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQD8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQD8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQD8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQD8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQD8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQD8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQD8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQD8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQD8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQD8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms