Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PPC4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PPC4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1W2PPC4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1W2PPC4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPC4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PPC4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms