Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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