Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms