Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL42Q9P2K6 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL42Q9P2K6 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms