Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms