Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP34Q70CQ2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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