Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms