Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS9

USP39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39Q53GS9 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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USP39Q53GS9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP39Q53GS9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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USP39Q53GS9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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USP39Q53GS9 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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USP39Q53GS9 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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USP39Q53GS9 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP39Q53GS9 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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