Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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