Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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