Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms