Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms