Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms