Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms