Protein–RNA interactions for Protein: P63128

ERVK-9, Endogenous retrovirus group K member 9 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-9P63128 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-9P63128 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms