Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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USP46P62068 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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USP46P62068 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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USP46P62068 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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USP46P62068 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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USP46P62068 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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USP46P62068 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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USP46P62068 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP46P62068 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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USP46P62068 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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USP46P62068 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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USP46P62068 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP46P62068 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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