Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP5P45974 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP5P45974 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP5P45974 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP5P45974 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP5P45974 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP5P45974 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP5P45974 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP5P45974 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP5P45974 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP5P45974 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP5P45974 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP5P45974 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP5P45974 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
USP5P45974 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms