Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAEP38570 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms