Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms