Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTGS1P23219 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms