Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms