Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms