Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms