Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRACR2AQ9BSW2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms