Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RETNLBQ9BQ08 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms