Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms