Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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HDAC11Q96DB2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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HDAC11Q96DB2 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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