Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms