Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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