Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN2Q02246 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms