Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP46P62068 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP46P62068 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP46P62068 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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