Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CLDN15P56746 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms