Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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