Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCKAP1LP55160 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms