Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms