Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP4P49662 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP4P49662 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP4P49662 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms