Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
COPB2P35606 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPB2P35606 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPB2P35606 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COPB2P35606 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPB2P35606 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPB2P35606 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPB2P35606 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPB2P35606 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPB2P35606 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPB2P35606 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPB2P35606 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms