Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2AP24928 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms