Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRCP23327 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRCP23327 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRCP23327 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms